Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SMARCA4P51532 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms