Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DAP3P51398 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DAP3P51398 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DAP3P51398 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DAP3P51398 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DAP3P51398 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DAP3P51398 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DAP3P51398 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
DAP3P51398 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DAP3P51398 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DAP3P51398 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DAP3P51398 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DAP3P51398 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DAP3P51398 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DAP3P51398 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DAP3P51398 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DAP3P51398 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
DAP3P51398 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DAP3P51398 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DAP3P51398 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DAP3P51398 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DAP3P51398 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
DAP3P51398 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DAP3P51398 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DAP3P51398 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DAP3P51398 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DAP3P51398 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DAP3P51398 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DAP3P51398 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DAP3P51398 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DAP3P51398 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DAP3P51398 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DAP3P51398 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DAP3P51398 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DAP3P51398 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DAP3P51398 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DAP3P51398 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DAP3P51398 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DAP3P51398 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DAP3P51398 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DAP3P51398 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DAP3P51398 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DAP3P51398 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
DAP3P51398 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
DAP3P51398 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DAP3P51398 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DAP3P51398 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DAP3P51398 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DAP3P51398 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
DAP3P51398 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
DAP3P51398 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DAP3P51398 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DAP3P51398 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DAP3P51398 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
DAP3P51398 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DAP3P51398 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DAP3P51398 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DAP3P51398 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DAP3P51398 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DAP3P51398 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DAP3P51398 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
DAP3P51398 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DAP3P51398 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DAP3P51398 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
DAP3P51398 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DAP3P51398 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DAP3P51398 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DAP3P51398 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DAP3P51398 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
DAP3P51398 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DAP3P51398 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DAP3P51398 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DAP3P51398 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DAP3P51398 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DAP3P51398 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DAP3P51398 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DAP3P51398 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DAP3P51398 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DAP3P51398 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DAP3P51398 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DAP3P51398 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DAP3P51398 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DAP3P51398 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DAP3P51398 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DAP3P51398 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DAP3P51398 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DAP3P51398 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DAP3P51398 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DAP3P51398 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DAP3P51398 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DAP3P51398 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
DAP3P51398 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DAP3P51398 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DAP3P51398 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DAP3P51398 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DAP3P51398 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DAP3P51398 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DAP3P51398 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DAP3P51398 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DAP3P51398 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms