Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERFP50548 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERFP50548 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERFP50548 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERFP50548 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERFP50548 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERFP50548 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERFP50548 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERFP50548 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERFP50548 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ERFP50548 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERFP50548 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERFP50548 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERFP50548 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERFP50548 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERFP50548 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERFP50548 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERFP50548 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERFP50548 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ERFP50548 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERFP50548 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERFP50548 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERFP50548 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERFP50548 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERFP50548 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERFP50548 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERFP50548 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERFP50548 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERFP50548 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERFP50548 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERFP50548 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERFP50548 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERFP50548 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERFP50548 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERFP50548 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERFP50548 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERFP50548 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERFP50548 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERFP50548 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERFP50548 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERFP50548 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERFP50548 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERFP50548 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERFP50548 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERFP50548 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERFP50548 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERFP50548 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERFP50548 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERFP50548 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ERFP50548 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERFP50548 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERFP50548 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERFP50548 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ERFP50548 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERFP50548 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERFP50548 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERFP50548 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERFP50548 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERFP50548 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERFP50548 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERFP50548 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERFP50548 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERFP50548 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERFP50548 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERFP50548 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERFP50548 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERFP50548 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERFP50548 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERFP50548 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERFP50548 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERFP50548 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERFP50548 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERFP50548 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERFP50548 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERFP50548 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERFP50548 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERFP50548 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERFP50548 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERFP50548 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERFP50548 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERFP50548 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ERFP50548 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ERFP50548 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERFP50548 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERFP50548 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERFP50548 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERFP50548 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERFP50548 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERFP50548 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERFP50548 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERFP50548 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERFP50548 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERFP50548 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERFP50548 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERFP50548 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERFP50548 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERFP50548 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERFP50548 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERFP50548 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ERFP50548 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms