Protein–RNA interactions for Protein: P49798

RGS4, Regulator of G-protein signaling 4, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGS4P49798 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RGS4P49798 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RGS4P49798 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RGS4P49798 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RGS4P49798 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RGS4P49798 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RGS4P49798 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RGS4P49798 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RGS4P49798 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RGS4P49798 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RGS4P49798 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RGS4P49798 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RGS4P49798 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RGS4P49798 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RGS4P49798 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RGS4P49798 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RGS4P49798 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RGS4P49798 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RGS4P49798 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RGS4P49798 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RGS4P49798 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RGS4P49798 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RGS4P49798 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RGS4P49798 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RGS4P49798 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RGS4P49798 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RGS4P49798 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RGS4P49798 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RGS4P49798 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RGS4P49798 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RGS4P49798 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RGS4P49798 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RGS4P49798 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RGS4P49798 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RGS4P49798 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RGS4P49798 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RGS4P49798 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RGS4P49798 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RGS4P49798 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RGS4P49798 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RGS4P49798 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RGS4P49798 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RGS4P49798 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RGS4P49798 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RGS4P49798 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RGS4P49798 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RGS4P49798 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RGS4P49798 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RGS4P49798 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RGS4P49798 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RGS4P49798 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RGS4P49798 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RGS4P49798 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RGS4P49798 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RGS4P49798 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RGS4P49798 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RGS4P49798 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RGS4P49798 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RGS4P49798 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RGS4P49798 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RGS4P49798 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RGS4P49798 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RGS4P49798 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RGS4P49798 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RGS4P49798 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RGS4P49798 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RGS4P49798 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RGS4P49798 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RGS4P49798 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RGS4P49798 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RGS4P49798 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RGS4P49798 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RGS4P49798 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RGS4P49798 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RGS4P49798 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RGS4P49798 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RGS4P49798 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RGS4P49798 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RGS4P49798 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RGS4P49798 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RGS4P49798 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RGS4P49798 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RGS4P49798 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RGS4P49798 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RGS4P49798 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RGS4P49798 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RGS4P49798 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RGS4P49798 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RGS4P49798 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RGS4P49798 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RGS4P49798 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RGS4P49798 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RGS4P49798 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RGS4P49798 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RGS4P49798 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RGS4P49798 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RGS4P49798 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RGS4P49798 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RGS4P49798 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RGS4P49798 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.5 ms