Protein–RNA interactions for Protein: P49023

PXN, Paxillin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXNP49023 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PXNP49023 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PXNP49023 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PXNP49023 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PXNP49023 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PXNP49023 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PXNP49023 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PXNP49023 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PXNP49023 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PXNP49023 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PXNP49023 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PXNP49023 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PXNP49023 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PXNP49023 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PXNP49023 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PXNP49023 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PXNP49023 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PXNP49023 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PXNP49023 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PXNP49023 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PXNP49023 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PXNP49023 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PXNP49023 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PXNP49023 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PXNP49023 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PXNP49023 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PXNP49023 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PXNP49023 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PXNP49023 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PXNP49023 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PXNP49023 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PXNP49023 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PXNP49023 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PXNP49023 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PXNP49023 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PXNP49023 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PXNP49023 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PXNP49023 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PXNP49023 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PXNP49023 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PXNP49023 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PXNP49023 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PXNP49023 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PXNP49023 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PXNP49023 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PXNP49023 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PXNP49023 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PXNP49023 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PXNP49023 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PXNP49023 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PXNP49023 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PXNP49023 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PXNP49023 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PXNP49023 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PXNP49023 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PXNP49023 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PXNP49023 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PXNP49023 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PXNP49023 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PXNP49023 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PXNP49023 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PXNP49023 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PXNP49023 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PXNP49023 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PXNP49023 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PXNP49023 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PXNP49023 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PXNP49023 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PXNP49023 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PXNP49023 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PXNP49023 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PXNP49023 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PXNP49023 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PXNP49023 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PXNP49023 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PXNP49023 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PXNP49023 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PXNP49023 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PXNP49023 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PXNP49023 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PXNP49023 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PXNP49023 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PXNP49023 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PXNP49023 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PXNP49023 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PXNP49023 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PXNP49023 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PXNP49023 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PXNP49023 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PXNP49023 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PXNP49023 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PXNP49023 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PXNP49023 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PXNP49023 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PXNP49023 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PXNP49023 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PXNP49023 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PXNP49023 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PXNP49023 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PXNP49023 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms