Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHRNA4P43681 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms