Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGAEP38570 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGAEP38570 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms