Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TGFBR1P36897 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TGFBR1P36897 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TGFBR1P36897 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TGFBR1P36897 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TGFBR1P36897 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TGFBR1P36897 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TGFBR1P36897 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TGFBR1P36897 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGFBR1P36897 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGFBR1P36897 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGFBR1P36897 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGFBR1P36897 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGFBR1P36897 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGFBR1P36897 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGFBR1P36897 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGFBR1P36897 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGFBR1P36897 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGFBR1P36897 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGFBR1P36897 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGFBR1P36897 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGFBR1P36897 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGFBR1P36897 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TGFBR1P36897 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGFBR1P36897 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGFBR1P36897 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGFBR1P36897 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGFBR1P36897 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGFBR1P36897 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGFBR1P36897 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TGFBR1P36897 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TGFBR1P36897 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGFBR1P36897 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGFBR1P36897 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGFBR1P36897 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TGFBR1P36897 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGFBR1P36897 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGFBR1P36897 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TGFBR1P36897 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGFBR1P36897 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGFBR1P36897 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGFBR1P36897 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGFBR1P36897 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGFBR1P36897 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGFBR1P36897 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGFBR1P36897 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGFBR1P36897 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGFBR1P36897 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGFBR1P36897 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGFBR1P36897 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGFBR1P36897 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TGFBR1P36897 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGFBR1P36897 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TGFBR1P36897 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGFBR1P36897 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGFBR1P36897 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGFBR1P36897 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TGFBR1P36897 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGFBR1P36897 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGFBR1P36897 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGFBR1P36897 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TGFBR1P36897 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TGFBR1P36897 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGFBR1P36897 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGFBR1P36897 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGFBR1P36897 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGFBR1P36897 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGFBR1P36897 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGFBR1P36897 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGFBR1P36897 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGFBR1P36897 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGFBR1P36897 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGFBR1P36897 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGFBR1P36897 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGFBR1P36897 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGFBR1P36897 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGFBR1P36897 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGFBR1P36897 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGFBR1P36897 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TGFBR1P36897 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TGFBR1P36897 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TGFBR1P36897 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGFBR1P36897 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGFBR1P36897 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGFBR1P36897 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGFBR1P36897 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGFBR1P36897 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGFBR1P36897 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGFBR1P36897 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGFBR1P36897 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGFBR1P36897 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGFBR1P36897 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGFBR1P36897 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGFBR1P36897 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGFBR1P36897 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGFBR1P36897 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGFBR1P36897 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGFBR1P36897 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGFBR1P36897 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TGFBR1P36897 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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