Protein–RNA interactions for Protein: P30405

PPIF, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPIFP30405 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PPIFP30405 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PPIFP30405 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PPIFP30405 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PPIFP30405 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PPIFP30405 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PPIFP30405 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PPIFP30405 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PPIFP30405 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PPIFP30405 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PPIFP30405 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PPIFP30405 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PPIFP30405 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PPIFP30405 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PPIFP30405 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PPIFP30405 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PPIFP30405 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PPIFP30405 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PPIFP30405 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PPIFP30405 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PPIFP30405 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PPIFP30405 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PPIFP30405 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PPIFP30405 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PPIFP30405 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PPIFP30405 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PPIFP30405 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PPIFP30405 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PPIFP30405 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PPIFP30405 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PPIFP30405 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PPIFP30405 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PPIFP30405 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PPIFP30405 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PPIFP30405 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PPIFP30405 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PPIFP30405 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PPIFP30405 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PPIFP30405 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PPIFP30405 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PPIFP30405 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PPIFP30405 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PPIFP30405 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PPIFP30405 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PPIFP30405 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PPIFP30405 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PPIFP30405 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PPIFP30405 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PPIFP30405 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PPIFP30405 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PPIFP30405 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PPIFP30405 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PPIFP30405 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PPIFP30405 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PPIFP30405 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PPIFP30405 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PPIFP30405 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PPIFP30405 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PPIFP30405 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PPIFP30405 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PPIFP30405 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PPIFP30405 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PPIFP30405 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PPIFP30405 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PPIFP30405 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PPIFP30405 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PPIFP30405 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PPIFP30405 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PPIFP30405 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PPIFP30405 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PPIFP30405 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PPIFP30405 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PPIFP30405 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PPIFP30405 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PPIFP30405 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PPIFP30405 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PPIFP30405 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PPIFP30405 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PPIFP30405 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PPIFP30405 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PPIFP30405 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PPIFP30405 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PPIFP30405 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PPIFP30405 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PPIFP30405 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PPIFP30405 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PPIFP30405 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PPIFP30405 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PPIFP30405 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PPIFP30405 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PPIFP30405 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PPIFP30405 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PPIFP30405 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PPIFP30405 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PPIFP30405 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PPIFP30405 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PPIFP30405 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PPIFP30405 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PPIFP30405 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PPIFP30405 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms