Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CD40LGP29965 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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