Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GJB2P29033 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GJB2P29033 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GJB2P29033 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GJB2P29033 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GJB2P29033 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GJB2P29033 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GJB2P29033 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GJB2P29033 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GJB2P29033 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GJB2P29033 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GJB2P29033 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GJB2P29033 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GJB2P29033 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GJB2P29033 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJB2P29033 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJB2P29033 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJB2P29033 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJB2P29033 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJB2P29033 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJB2P29033 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJB2P29033 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJB2P29033 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJB2P29033 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJB2P29033 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJB2P29033 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJB2P29033 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJB2P29033 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GJB2P29033 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJB2P29033 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJB2P29033 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJB2P29033 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJB2P29033 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJB2P29033 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJB2P29033 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJB2P29033 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GJB2P29033 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJB2P29033 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJB2P29033 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJB2P29033 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GJB2P29033 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GJB2P29033 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJB2P29033 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJB2P29033 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJB2P29033 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJB2P29033 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GJB2P29033 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJB2P29033 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJB2P29033 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJB2P29033 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJB2P29033 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJB2P29033 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJB2P29033 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJB2P29033 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJB2P29033 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJB2P29033 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJB2P29033 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJB2P29033 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GJB2P29033 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJB2P29033 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJB2P29033 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJB2P29033 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJB2P29033 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJB2P29033 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJB2P29033 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJB2P29033 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJB2P29033 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GJB2P29033 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJB2P29033 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJB2P29033 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJB2P29033 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJB2P29033 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJB2P29033 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJB2P29033 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJB2P29033 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJB2P29033 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GJB2P29033 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GJB2P29033 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJB2P29033 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJB2P29033 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJB2P29033 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJB2P29033 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJB2P29033 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJB2P29033 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GJB2P29033 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GJB2P29033 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GJB2P29033 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJB2P29033 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJB2P29033 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJB2P29033 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJB2P29033 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJB2P29033 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJB2P29033 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJB2P29033 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJB2P29033 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJB2P29033 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJB2P29033 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJB2P29033 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJB2P29033 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GJB2P29033 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms