Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PLNP26678 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PLNP26678 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PLNP26678 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PLNP26678 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PLNP26678 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PLNP26678 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PLNP26678 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PLNP26678 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PLNP26678 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PLNP26678 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PLNP26678 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PLNP26678 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PLNP26678 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PLNP26678 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PLNP26678 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PLNP26678 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PLNP26678 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PLNP26678 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PLNP26678 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PLNP26678 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PLNP26678 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PLNP26678 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PLNP26678 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PLNP26678 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PLNP26678 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PLNP26678 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PLNP26678 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PLNP26678 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PLNP26678 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PLNP26678 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PLNP26678 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PLNP26678 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PLNP26678 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PLNP26678 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PLNP26678 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PLNP26678 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PLNP26678 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PLNP26678 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PLNP26678 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PLNP26678 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PLNP26678 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PLNP26678 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PLNP26678 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PLNP26678 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PLNP26678 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PLNP26678 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PLNP26678 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PLNP26678 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PLNP26678 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PLNP26678 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PLNP26678 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PLNP26678 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PLNP26678 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PLNP26678 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PLNP26678 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PLNP26678 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PLNP26678 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PLNP26678 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PLNP26678 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PLNP26678 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PLNP26678 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PLNP26678 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PLNP26678 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PLNP26678 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PLNP26678 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PLNP26678 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PLNP26678 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PLNP26678 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PLNP26678 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PLNP26678 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PLNP26678 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PLNP26678 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PLNP26678 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PLNP26678 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PLNP26678 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PLNP26678 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PLNP26678 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PLNP26678 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PLNP26678 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PLNP26678 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PLNP26678 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PLNP26678 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PLNP26678 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PLNP26678 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PLNP26678 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PLNP26678 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PLNP26678 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PLNP26678 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PLNP26678 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PLNP26678 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PLNP26678 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PLNP26678 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
PLNP26678 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
PLNP26678 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PLNP26678 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PLNP26678 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PLNP26678 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PLNP26678 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PLNP26678 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms