Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA1P20827 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
EFNA1P20827 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
EFNA1P20827 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
EFNA1P20827 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
EFNA1P20827 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
EFNA1P20827 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
EFNA1P20827 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
EFNA1P20827 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
EFNA1P20827 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNA1P20827 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNA1P20827 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNA1P20827 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNA1P20827 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNA1P20827 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNA1P20827 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNA1P20827 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNA1P20827 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNA1P20827 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNA1P20827 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNA1P20827 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNA1P20827 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNA1P20827 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNA1P20827 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNA1P20827 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNA1P20827 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNA1P20827 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNA1P20827 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNA1P20827 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNA1P20827 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNA1P20827 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNA1P20827 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNA1P20827 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNA1P20827 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNA1P20827 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNA1P20827 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNA1P20827 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNA1P20827 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNA1P20827 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNA1P20827 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNA1P20827 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNA1P20827 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EFNA1P20827 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EFNA1P20827 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EFNA1P20827 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EFNA1P20827 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EFNA1P20827 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EFNA1P20827 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EFNA1P20827 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EFNA1P20827 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EFNA1P20827 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EFNA1P20827 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EFNA1P20827 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EFNA1P20827 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EFNA1P20827 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EFNA1P20827 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EFNA1P20827 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms