Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCNA2P20248 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms