Protein–RNA interactions for Protein: P19013

KRT4, Keratin, type II cytoskeletal 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT4P19013 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
KRT4P19013 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRT4P19013 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRT4P19013 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRT4P19013 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRT4P19013 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRT4P19013 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRT4P19013 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRT4P19013 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRT4P19013 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRT4P19013 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRT4P19013 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
KRT4P19013 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRT4P19013 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT4P19013 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT4P19013 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT4P19013 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT4P19013 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT4P19013 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT4P19013 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT4P19013 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT4P19013 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT4P19013 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT4P19013 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT4P19013 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT4P19013 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT4P19013 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT4P19013 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT4P19013 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT4P19013 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT4P19013 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT4P19013 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT4P19013 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT4P19013 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT4P19013 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT4P19013 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT4P19013 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT4P19013 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT4P19013 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT4P19013 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT4P19013 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT4P19013 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT4P19013 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT4P19013 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT4P19013 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT4P19013 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT4P19013 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT4P19013 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT4P19013 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT4P19013 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT4P19013 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT4P19013 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT4P19013 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT4P19013 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT4P19013 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT4P19013 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT4P19013 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT4P19013 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT4P19013 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT4P19013 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT4P19013 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT4P19013 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT4P19013 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT4P19013 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT4P19013 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT4P19013 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT4P19013 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT4P19013 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT4P19013 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT4P19013 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT4P19013 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT4P19013 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT4P19013 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT4P19013 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT4P19013 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT4P19013 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT4P19013 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT4P19013 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT4P19013 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT4P19013 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT4P19013 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT4P19013 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT4P19013 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT4P19013 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT4P19013 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT4P19013 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT4P19013 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT4P19013 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KRT4P19013 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KRT4P19013 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KRT4P19013 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KRT4P19013 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KRT4P19013 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
KRT4P19013 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KRT4P19013 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KRT4P19013 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KRT4P19013 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KRT4P19013 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KRT4P19013 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KRT4P19013 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms