Protein–RNA interactions for Protein: P18206

VCL, Vinculin, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCLP18206 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VCLP18206 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VCLP18206 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VCLP18206 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VCLP18206 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VCLP18206 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VCLP18206 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VCLP18206 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VCLP18206 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VCLP18206 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VCLP18206 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VCLP18206 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VCLP18206 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VCLP18206 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VCLP18206 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VCLP18206 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VCLP18206 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VCLP18206 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VCLP18206 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VCLP18206 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VCLP18206 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VCLP18206 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VCLP18206 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VCLP18206 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VCLP18206 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VCLP18206 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VCLP18206 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VCLP18206 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VCLP18206 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VCLP18206 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VCLP18206 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VCLP18206 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VCLP18206 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VCLP18206 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
VCLP18206 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VCLP18206 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VCLP18206 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
VCLP18206 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
VCLP18206 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VCLP18206 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VCLP18206 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VCLP18206 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VCLP18206 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VCLP18206 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VCLP18206 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VCLP18206 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VCLP18206 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VCLP18206 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VCLP18206 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VCLP18206 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VCLP18206 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VCLP18206 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VCLP18206 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VCLP18206 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VCLP18206 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VCLP18206 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VCLP18206 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VCLP18206 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VCLP18206 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VCLP18206 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VCLP18206 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VCLP18206 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
VCLP18206 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VCLP18206 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VCLP18206 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VCLP18206 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VCLP18206 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VCLP18206 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VCLP18206 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VCLP18206 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VCLP18206 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VCLP18206 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VCLP18206 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VCLP18206 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
VCLP18206 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
VCLP18206 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VCLP18206 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VCLP18206 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VCLP18206 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VCLP18206 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VCLP18206 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VCLP18206 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VCLP18206 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VCLP18206 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VCLP18206 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VCLP18206 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VCLP18206 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VCLP18206 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VCLP18206 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VCLP18206 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VCLP18206 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VCLP18206 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VCLP18206 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VCLP18206 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VCLP18206 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VCLP18206 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VCLP18206 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VCLP18206 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VCLP18206 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
VCLP18206 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms