Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRG2P13727 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRG2P13727 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRG2P13727 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRG2P13727 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PRG2P13727 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRG2P13727 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRG2P13727 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRG2P13727 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRG2P13727 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRG2P13727 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRG2P13727 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRG2P13727 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRG2P13727 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRG2P13727 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRG2P13727 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRG2P13727 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRG2P13727 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRG2P13727 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRG2P13727 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRG2P13727 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRG2P13727 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRG2P13727 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRG2P13727 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PRG2P13727 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRG2P13727 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PRG2P13727 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PRG2P13727 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRG2P13727 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRG2P13727 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRG2P13727 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRG2P13727 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRG2P13727 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRG2P13727 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRG2P13727 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRG2P13727 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRG2P13727 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRG2P13727 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRG2P13727 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRG2P13727 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRG2P13727 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRG2P13727 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PRG2P13727 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRG2P13727 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRG2P13727 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRG2P13727 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRG2P13727 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRG2P13727 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRG2P13727 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRG2P13727 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRG2P13727 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRG2P13727 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRG2P13727 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRG2P13727 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PRG2P13727 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRG2P13727 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRG2P13727 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRG2P13727 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRG2P13727 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRG2P13727 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PRG2P13727 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRG2P13727 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PRG2P13727 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRG2P13727 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRG2P13727 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRG2P13727 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRG2P13727 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRG2P13727 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRG2P13727 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PRG2P13727 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PRG2P13727 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRG2P13727 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRG2P13727 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRG2P13727 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRG2P13727 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRG2P13727 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRG2P13727 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRG2P13727 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRG2P13727 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRG2P13727 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRG2P13727 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRG2P13727 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRG2P13727 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRG2P13727 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRG2P13727 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRG2P13727 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRG2P13727 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRG2P13727 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRG2P13727 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRG2P13727 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PRG2P13727 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRG2P13727 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRG2P13727 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRG2P13727 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRG2P13727 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRG2P13727 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRG2P13727 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRG2P13727 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRG2P13727 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PRG2P13727 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms