Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■■□□ 2
CFTRP13569 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC27.51■■■□□ 2
CFTRP13569 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC27.51■■■□□ 2
CFTRP13569 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC27.51■■■□□ 2
CFTRP13569 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CFTRP13569 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CFTRP13569 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CFTRP13569 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CFTRP13569 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CFTRP13569 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CFTRP13569 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CFTRP13569 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CFTRP13569 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CFTRP13569 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CFTRP13569 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CFTRP13569 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CFTRP13569 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CFTRP13569 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CFTRP13569 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CFTRP13569 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CFTRP13569 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CFTRP13569 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CFTRP13569 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CFTRP13569 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CFTRP13569 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CFTRP13569 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CFTRP13569 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CFTRP13569 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CFTRP13569 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CFTRP13569 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CFTRP13569 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CFTRP13569 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CFTRP13569 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CFTRP13569 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CFTRP13569 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CFTRP13569 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CFTRP13569 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CFTRP13569 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CFTRP13569 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CFTRP13569 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CFTRP13569 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CFTRP13569 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CFTRP13569 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CFTRP13569 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CFTRP13569 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CFTRP13569 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CFTRP13569 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CFTRP13569 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CFTRP13569 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CFTRP13569 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CFTRP13569 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CFTRP13569 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CFTRP13569 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CFTRP13569 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CFTRP13569 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CFTRP13569 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CFTRP13569 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CFTRP13569 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CFTRP13569 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CFTRP13569 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CFTRP13569 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CFTRP13569 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CFTRP13569 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CFTRP13569 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CFTRP13569 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CFTRP13569 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CFTRP13569 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CFTRP13569 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CFTRP13569 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CFTRP13569 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CFTRP13569 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CFTRP13569 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CFTRP13569 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CFTRP13569 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CFTRP13569 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CFTRP13569 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CFTRP13569 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CFTRP13569 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CFTRP13569 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CFTRP13569 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CFTRP13569 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CFTRP13569 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CFTRP13569 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CFTRP13569 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CFTRP13569 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CFTRP13569 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CFTRP13569 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CFTRP13569 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CFTRP13569 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CFTRP13569 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CFTRP13569 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CFTRP13569 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CFTRP13569 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CFTRP13569 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CFTRP13569 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CFTRP13569 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CFTRP13569 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CFTRP13569 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CFTRP13569 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CFTRP13569 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms