Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NEFHP12036 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
NEFHP12036 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NEFHP12036 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NEFHP12036 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NEFHP12036 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEFHP12036 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEFHP12036 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEFHP12036 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEFHP12036 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEFHP12036 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEFHP12036 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NEFHP12036 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEFHP12036 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEFHP12036 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEFHP12036 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEFHP12036 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEFHP12036 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEFHP12036 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEFHP12036 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEFHP12036 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEFHP12036 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEFHP12036 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEFHP12036 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEFHP12036 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEFHP12036 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEFHP12036 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEFHP12036 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NEFHP12036 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEFHP12036 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEFHP12036 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NEFHP12036 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEFHP12036 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEFHP12036 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEFHP12036 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEFHP12036 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEFHP12036 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEFHP12036 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEFHP12036 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEFHP12036 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEFHP12036 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEFHP12036 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEFHP12036 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEFHP12036 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NEFHP12036 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEFHP12036 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEFHP12036 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEFHP12036 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEFHP12036 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEFHP12036 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEFHP12036 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEFHP12036 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEFHP12036 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEFHP12036 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEFHP12036 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEFHP12036 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEFHP12036 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEFHP12036 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEFHP12036 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEFHP12036 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEFHP12036 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEFHP12036 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEFHP12036 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEFHP12036 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NEFHP12036 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NEFHP12036 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEFHP12036 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEFHP12036 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEFHP12036 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEFHP12036 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEFHP12036 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEFHP12036 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEFHP12036 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEFHP12036 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEFHP12036 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEFHP12036 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEFHP12036 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEFHP12036 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEFHP12036 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEFHP12036 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEFHP12036 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEFHP12036 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEFHP12036 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEFHP12036 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEFHP12036 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEFHP12036 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEFHP12036 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEFHP12036 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEFHP12036 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEFHP12036 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEFHP12036 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEFHP12036 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEFHP12036 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEFHP12036 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEFHP12036 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEFHP12036 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEFHP12036 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEFHP12036 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEFHP12036 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEFHP12036 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms