Protein–RNA interactions for Protein: P0CF97

FAM200B, Protein FAM200B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM200BP0CF97 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM200BP0CF97 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM200BP0CF97 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM200BP0CF97 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM200BP0CF97 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM200BP0CF97 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM200BP0CF97 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM200BP0CF97 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM200BP0CF97 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM200BP0CF97 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM200BP0CF97 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM200BP0CF97 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM200BP0CF97 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM200BP0CF97 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM200BP0CF97 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM200BP0CF97 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM200BP0CF97 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM200BP0CF97 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM200BP0CF97 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM200BP0CF97 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM200BP0CF97 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM200BP0CF97 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM200BP0CF97 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM200BP0CF97 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM200BP0CF97 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM200BP0CF97 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM200BP0CF97 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM200BP0CF97 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM200BP0CF97 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM200BP0CF97 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM200BP0CF97 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM200BP0CF97 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM200BP0CF97 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM200BP0CF97 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM200BP0CF97 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM200BP0CF97 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM200BP0CF97 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM200BP0CF97 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM200BP0CF97 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM200BP0CF97 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM200BP0CF97 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM200BP0CF97 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM200BP0CF97 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM200BP0CF97 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM200BP0CF97 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM200BP0CF97 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM200BP0CF97 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM200BP0CF97 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM200BP0CF97 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM200BP0CF97 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM200BP0CF97 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM200BP0CF97 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM200BP0CF97 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM200BP0CF97 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM200BP0CF97 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM200BP0CF97 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM200BP0CF97 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM200BP0CF97 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM200BP0CF97 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM200BP0CF97 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM200BP0CF97 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM200BP0CF97 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM200BP0CF97 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM200BP0CF97 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM200BP0CF97 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM200BP0CF97 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM200BP0CF97 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM200BP0CF97 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM200BP0CF97 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM200BP0CF97 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM200BP0CF97 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM200BP0CF97 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM200BP0CF97 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM200BP0CF97 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM200BP0CF97 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM200BP0CF97 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM200BP0CF97 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM200BP0CF97 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM200BP0CF97 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM200BP0CF97 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM200BP0CF97 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM200BP0CF97 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM200BP0CF97 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM200BP0CF97 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM200BP0CF97 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM200BP0CF97 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM200BP0CF97 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM200BP0CF97 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM200BP0CF97 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM200BP0CF97 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM200BP0CF97 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM200BP0CF97 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM200BP0CF97 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM200BP0CF97 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM200BP0CF97 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM200BP0CF97 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM200BP0CF97 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM200BP0CF97 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM200BP0CF97 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FAM200BP0CF97 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
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