Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
PKHD1P08F94 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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