Protein–RNA interactions for Protein: P08700

IL3, Interleukin-3, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3P08700 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL3P08700 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL3P08700 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL3P08700 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL3P08700 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL3P08700 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL3P08700 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL3P08700 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL3P08700 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL3P08700 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL3P08700 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL3P08700 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL3P08700 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL3P08700 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL3P08700 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
IL3P08700 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL3P08700 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
IL3P08700 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL3P08700 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL3P08700 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL3P08700 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL3P08700 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL3P08700 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL3P08700 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL3P08700 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL3P08700 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL3P08700 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL3P08700 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL3P08700 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL3P08700 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL3P08700 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL3P08700 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL3P08700 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL3P08700 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL3P08700 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL3P08700 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
IL3P08700 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL3P08700 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL3P08700 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL3P08700 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL3P08700 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL3P08700 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL3P08700 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL3P08700 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL3P08700 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL3P08700 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL3P08700 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
IL3P08700 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL3P08700 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL3P08700 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL3P08700 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL3P08700 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL3P08700 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL3P08700 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL3P08700 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL3P08700 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL3P08700 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL3P08700 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL3P08700 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL3P08700 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL3P08700 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL3P08700 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL3P08700 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL3P08700 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL3P08700 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL3P08700 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL3P08700 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL3P08700 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL3P08700 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL3P08700 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL3P08700 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL3P08700 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL3P08700 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL3P08700 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL3P08700 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL3P08700 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL3P08700 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL3P08700 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL3P08700 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL3P08700 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL3P08700 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL3P08700 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
IL3P08700 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL3P08700 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL3P08700 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL3P08700 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL3P08700 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL3P08700 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL3P08700 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL3P08700 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL3P08700 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IL3P08700 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IL3P08700 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IL3P08700 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IL3P08700 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IL3P08700 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IL3P08700 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IL3P08700 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IL3P08700 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IL3P08700 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms