Protein–RNA interactions for Protein: P01130

LDLR, Low-density lipoprotein receptor, humanhuman

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Length 860 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRP01130 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LDLRP01130 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LDLRP01130 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LDLRP01130 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LDLRP01130 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LDLRP01130 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LDLRP01130 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LDLRP01130 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LDLRP01130 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LDLRP01130 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LDLRP01130 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LDLRP01130 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LDLRP01130 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LDLRP01130 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LDLRP01130 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LDLRP01130 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LDLRP01130 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LDLRP01130 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LDLRP01130 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LDLRP01130 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRP01130 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRP01130 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRP01130 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRP01130 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRP01130 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRP01130 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRP01130 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRP01130 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRP01130 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRP01130 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRP01130 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRP01130 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRP01130 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRP01130 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRP01130 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRP01130 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRP01130 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRP01130 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRP01130 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRP01130 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRP01130 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRP01130 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRP01130 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRP01130 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRP01130 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRP01130 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRP01130 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRP01130 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRP01130 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRP01130 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRP01130 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRP01130 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRP01130 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRP01130 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRP01130 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRP01130 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRP01130 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRP01130 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRP01130 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRP01130 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRP01130 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRP01130 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRP01130 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRP01130 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRP01130 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRP01130 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRP01130 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRP01130 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRP01130 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRP01130 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRP01130 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRP01130 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRP01130 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRP01130 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRP01130 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRP01130 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LDLRP01130 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LDLRP01130 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LDLRP01130 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LDLRP01130 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LDLRP01130 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LDLRP01130 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LDLRP01130 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LDLRP01130 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LDLRP01130 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LDLRP01130 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LDLRP01130 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LDLRP01130 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LDLRP01130 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LDLRP01130 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LDLRP01130 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LDLRP01130 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LDLRP01130 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LDLRP01130 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LDLRP01130 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LDLRP01130 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LDLRP01130 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LDLRP01130 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LDLRP01130 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LDLRP01130 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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