Protein–RNA interactions for Protein: O60809

PRAMEF10, PRAME family member 10, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF10O60809 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms