Protein–RNA interactions for Protein: O43556

SGCE, Epsilon-sarcoglycan, humanhuman

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Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCEO43556 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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SGCEO43556 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCEO43556 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCEO43556 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCEO43556 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCEO43556 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCEO43556 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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SGCEO43556 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCEO43556 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCEO43556 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCEO43556 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCEO43556 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGCEO43556 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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SGCEO43556 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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SGCEO43556 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGCEO43556 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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SGCEO43556 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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SGCEO43556 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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SGCEO43556 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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SGCEO43556 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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SGCEO43556 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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SGCEO43556 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCEO43556 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCEO43556 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCEO43556 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCEO43556 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCEO43556 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCEO43556 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCEO43556 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCEO43556 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCEO43556 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SGCEO43556 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SGCEO43556 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SGCEO43556 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SGCEO43556 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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