Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CACNA1GO43497 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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