Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COCHO43405 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COCHO43405 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
COCHO43405 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COCHO43405 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COCHO43405 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
COCHO43405 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COCHO43405 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COCHO43405 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COCHO43405 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COCHO43405 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COCHO43405 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COCHO43405 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
COCHO43405 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COCHO43405 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
COCHO43405 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
COCHO43405 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
COCHO43405 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
COCHO43405 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
COCHO43405 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
COCHO43405 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COCHO43405 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
COCHO43405 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
COCHO43405 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COCHO43405 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
COCHO43405 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COCHO43405 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COCHO43405 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COCHO43405 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COCHO43405 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
COCHO43405 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
COCHO43405 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COCHO43405 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COCHO43405 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COCHO43405 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
COCHO43405 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COCHO43405 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COCHO43405 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COCHO43405 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
COCHO43405 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
COCHO43405 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COCHO43405 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
COCHO43405 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COCHO43405 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
COCHO43405 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COCHO43405 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COCHO43405 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COCHO43405 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COCHO43405 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COCHO43405 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COCHO43405 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COCHO43405 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COCHO43405 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COCHO43405 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COCHO43405 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COCHO43405 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COCHO43405 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COCHO43405 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COCHO43405 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COCHO43405 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COCHO43405 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COCHO43405 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COCHO43405 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COCHO43405 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COCHO43405 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COCHO43405 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COCHO43405 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COCHO43405 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COCHO43405 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COCHO43405 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COCHO43405 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
COCHO43405 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COCHO43405 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COCHO43405 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COCHO43405 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COCHO43405 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
COCHO43405 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COCHO43405 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COCHO43405 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COCHO43405 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COCHO43405 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COCHO43405 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COCHO43405 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COCHO43405 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COCHO43405 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COCHO43405 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COCHO43405 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COCHO43405 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COCHO43405 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COCHO43405 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COCHO43405 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COCHO43405 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COCHO43405 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COCHO43405 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
COCHO43405 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
COCHO43405 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
COCHO43405 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
COCHO43405 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COCHO43405 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
COCHO43405 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms