Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBDO15205 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBDO15205 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBDO15205 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBDO15205 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBDO15205 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBDO15205 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBDO15205 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBDO15205 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBDO15205 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBDO15205 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBDO15205 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBDO15205 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBDO15205 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBDO15205 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBDO15205 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBDO15205 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBDO15205 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UBDO15205 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBDO15205 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBDO15205 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UBDO15205 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBDO15205 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBDO15205 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBDO15205 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UBDO15205 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBDO15205 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBDO15205 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBDO15205 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBDO15205 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UBDO15205 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UBDO15205 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBDO15205 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBDO15205 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBDO15205 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBDO15205 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBDO15205 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBDO15205 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBDO15205 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBDO15205 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBDO15205 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBDO15205 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBDO15205 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBDO15205 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBDO15205 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBDO15205 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBDO15205 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBDO15205 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBDO15205 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBDO15205 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBDO15205 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBDO15205 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBDO15205 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBDO15205 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBDO15205 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBDO15205 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBDO15205 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBDO15205 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBDO15205 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBDO15205 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBDO15205 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBDO15205 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBDO15205 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBDO15205 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
UBDO15205 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBDO15205 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBDO15205 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBDO15205 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBDO15205 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBDO15205 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBDO15205 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
UBDO15205 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBDO15205 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBDO15205 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBDO15205 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBDO15205 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
UBDO15205 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
UBDO15205 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBDO15205 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBDO15205 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBDO15205 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBDO15205 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBDO15205 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBDO15205 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBDO15205 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBDO15205 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBDO15205 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBDO15205 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBDO15205 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBDO15205 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBDO15205 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBDO15205 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UBDO15205 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBDO15205 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBDO15205 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBDO15205 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBDO15205 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBDO15205 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBDO15205 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UBDO15205 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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