Protein–RNA interactions for Protein: O15178

T, Brachyury protein, humanhuman

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Length 435 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TO15178 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TO15178 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TO15178 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TO15178 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TO15178 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TO15178 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TO15178 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TO15178 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TO15178 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TO15178 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TO15178 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TO15178 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TO15178 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TO15178 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TO15178 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TO15178 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TO15178 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TO15178 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TO15178 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TO15178 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TO15178 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TO15178 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TO15178 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TO15178 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TO15178 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TO15178 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TO15178 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TO15178 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TO15178 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TO15178 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TO15178 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TO15178 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TO15178 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TO15178 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TO15178 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TO15178 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TO15178 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TO15178 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TO15178 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TO15178 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TO15178 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TO15178 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TO15178 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TO15178 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TO15178 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TO15178 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TO15178 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TO15178 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TO15178 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TO15178 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TO15178 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TO15178 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TO15178 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TO15178 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TO15178 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TO15178 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TO15178 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TO15178 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TO15178 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TO15178 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TO15178 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TO15178 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TO15178 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TO15178 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TO15178 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TO15178 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TO15178 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TO15178 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TO15178 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TO15178 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TO15178 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TO15178 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TO15178 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TO15178 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TO15178 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TO15178 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TO15178 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TO15178 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TO15178 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TO15178 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TO15178 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TO15178 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TO15178 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TO15178 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TO15178 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TO15178 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TO15178 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TO15178 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TO15178 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TO15178 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TO15178 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TO15178 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TO15178 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TO15178 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TO15178 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TO15178 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TO15178 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TO15178 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TO15178 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TO15178 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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