Protein–RNA interactions for Protein: O15079

SNPH, Syntaphilin, humanhuman

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Length 494 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNPHO15079 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNPHO15079 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNPHO15079 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNPHO15079 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNPHO15079 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SNPHO15079 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNPHO15079 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNPHO15079 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNPHO15079 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNPHO15079 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNPHO15079 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNPHO15079 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNPHO15079 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNPHO15079 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNPHO15079 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNPHO15079 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNPHO15079 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNPHO15079 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNPHO15079 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNPHO15079 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNPHO15079 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SNPHO15079 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNPHO15079 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNPHO15079 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNPHO15079 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNPHO15079 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNPHO15079 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNPHO15079 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNPHO15079 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNPHO15079 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNPHO15079 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNPHO15079 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNPHO15079 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNPHO15079 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNPHO15079 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNPHO15079 AC003986.3-201ENST00000417460 692 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNPHO15079 AL513128.1-201ENST00000422675 469 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNPHO15079 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SNPHO15079 AC022395.1-201ENST00000451610 895 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNPHO15079 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNPHO15079 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNPHO15079 PRELID3BP7-201ENST00000503606 469 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SNPHO15079 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNPHO15079 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNPHO15079 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNPHO15079 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNPHO15079 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNPHO15079 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SNPHO15079 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNPHO15079 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SNPHO15079 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
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SNPHO15079 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNPHO15079 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNPHO15079 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNPHO15079 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNPHO15079 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNPHO15079 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNPHO15079 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNPHO15079 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNPHO15079 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNPHO15079 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNPHO15079 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNPHO15079 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNPHO15079 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNPHO15079 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNPHO15079 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNPHO15079 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNPHO15079 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNPHO15079 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNPHO15079 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SNPHO15079 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNPHO15079 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNPHO15079 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNPHO15079 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNPHO15079 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNPHO15079 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNPHO15079 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNPHO15079 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNPHO15079 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNPHO15079 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNPHO15079 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNPHO15079 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNPHO15079 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNPHO15079 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNPHO15079 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNPHO15079 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNPHO15079 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNPHO15079 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNPHO15079 AC011131.1-201ENST00000521224 252 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNPHO15079 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNPHO15079 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNPHO15079 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNPHO15079 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SNPHO15079 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNPHO15079 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNPHO15079 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNPHO15079 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SNPHO15079 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNPHO15079 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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