Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTDSP2O14595 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CTDSP2O14595 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CTDSP2O14595 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CTDSP2O14595 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
CTDSP2O14595 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CTDSP2O14595 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CTDSP2O14595 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CTDSP2O14595 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CTDSP2O14595 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CTDSP2O14595 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CTDSP2O14595 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CTDSP2O14595 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CTDSP2O14595 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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CTDSP2O14595 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CTDSP2O14595 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CTDSP2O14595 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CTDSP2O14595 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CTDSP2O14595 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CTDSP2O14595 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CTDSP2O14595 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CTDSP2O14595 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CTDSP2O14595 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
CTDSP2O14595 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CTDSP2O14595 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CTDSP2O14595 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CTDSP2O14595 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CTDSP2O14595 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CTDSP2O14595 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CTDSP2O14595 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CTDSP2O14595 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CTDSP2O14595 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CTDSP2O14595 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CTDSP2O14595 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CTDSP2O14595 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CTDSP2O14595 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CTDSP2O14595 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CTDSP2O14595 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CTDSP2O14595 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CTDSP2O14595 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CTDSP2O14595 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CTDSP2O14595 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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