Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms