Protein–RNA interactions for Protein: E9PKD4

NPIPA5, Nuclear pore complex-interacting protein family member A5, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA5E9PKD4 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPA5E9PKD4 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPA5E9PKD4 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms