Protein–RNA interactions for Protein: C9J3I9

C5orf58, Putative uncharacterized protein C5orf58, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf58C9J3I9 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C5orf58C9J3I9 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C5orf58C9J3I9 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C5orf58C9J3I9 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C5orf58C9J3I9 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C5orf58C9J3I9 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C5orf58C9J3I9 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C5orf58C9J3I9 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C5orf58C9J3I9 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C5orf58C9J3I9 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C5orf58C9J3I9 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C5orf58C9J3I9 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C5orf58C9J3I9 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C5orf58C9J3I9 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C5orf58C9J3I9 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C5orf58C9J3I9 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C5orf58C9J3I9 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C5orf58C9J3I9 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C5orf58C9J3I9 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C5orf58C9J3I9 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C5orf58C9J3I9 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C5orf58C9J3I9 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C5orf58C9J3I9 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C5orf58C9J3I9 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C5orf58C9J3I9 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C5orf58C9J3I9 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C5orf58C9J3I9 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C5orf58C9J3I9 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C5orf58C9J3I9 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C5orf58C9J3I9 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C5orf58C9J3I9 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C5orf58C9J3I9 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C5orf58C9J3I9 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C5orf58C9J3I9 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C5orf58C9J3I9 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C5orf58C9J3I9 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C5orf58C9J3I9 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C5orf58C9J3I9 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C5orf58C9J3I9 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C5orf58C9J3I9 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C5orf58C9J3I9 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
C5orf58C9J3I9 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C5orf58C9J3I9 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C5orf58C9J3I9 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C5orf58C9J3I9 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C5orf58C9J3I9 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C5orf58C9J3I9 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C5orf58C9J3I9 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C5orf58C9J3I9 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C5orf58C9J3I9 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C5orf58C9J3I9 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
C5orf58C9J3I9 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf58C9J3I9 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf58C9J3I9 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf58C9J3I9 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf58C9J3I9 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf58C9J3I9 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf58C9J3I9 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf58C9J3I9 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf58C9J3I9 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf58C9J3I9 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf58C9J3I9 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf58C9J3I9 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf58C9J3I9 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf58C9J3I9 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf58C9J3I9 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf58C9J3I9 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf58C9J3I9 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf58C9J3I9 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf58C9J3I9 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf58C9J3I9 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf58C9J3I9 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf58C9J3I9 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf58C9J3I9 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf58C9J3I9 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf58C9J3I9 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf58C9J3I9 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf58C9J3I9 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf58C9J3I9 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf58C9J3I9 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf58C9J3I9 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf58C9J3I9 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf58C9J3I9 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf58C9J3I9 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf58C9J3I9 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf58C9J3I9 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf58C9J3I9 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf58C9J3I9 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf58C9J3I9 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf58C9J3I9 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf58C9J3I9 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf58C9J3I9 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf58C9J3I9 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf58C9J3I9 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf58C9J3I9 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf58C9J3I9 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf58C9J3I9 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C5orf58C9J3I9 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C5orf58C9J3I9 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C5orf58C9J3I9 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms