Protein–RNA interactions for Protein: A7MD48

SRRM4, Serine/arginine repetitive matrix protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM4A7MD48 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SRRM4A7MD48 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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