Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC78A2IDD5 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms