Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX8Q9Y5X2 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms