Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X0

MED16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, humanhuman

Predictions only

Length 877 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED16Q9Y2X0 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MED16Q9Y2X0 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms