Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC8Q9Y2L5 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms