Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP20Q9Y2K6 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP20Q9Y2K6 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP20Q9Y2K6 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP20Q9Y2K6 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP20Q9Y2K6 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP20Q9Y2K6 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP20Q9Y2K6 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP20Q9Y2K6 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
USP20Q9Y2K6 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP20Q9Y2K6 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
USP20Q9Y2K6 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
USP20Q9Y2K6 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP20Q9Y2K6 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
USP20Q9Y2K6 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP20Q9Y2K6 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP20Q9Y2K6 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
USP20Q9Y2K6 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP20Q9Y2K6 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP20Q9Y2K6 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
USP20Q9Y2K6 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
USP20Q9Y2K6 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
USP20Q9Y2K6 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP20Q9Y2K6 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP20Q9Y2K6 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP20Q9Y2K6 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP20Q9Y2K6 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP20Q9Y2K6 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP20Q9Y2K6 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP20Q9Y2K6 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP20Q9Y2K6 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
USP20Q9Y2K6 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
USP20Q9Y2K6 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
USP20Q9Y2K6 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
USP20Q9Y2K6 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC18■□□□□ 0.47
USP20Q9Y2K6 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP20Q9Y2K6 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC18■□□□□ 0.47
USP20Q9Y2K6 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP20Q9Y2K6 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
USP20Q9Y2K6 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC18■□□□□ 0.47
USP20Q9Y2K6 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP20Q9Y2K6 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
USP20Q9Y2K6 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP20Q9Y2K6 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP20Q9Y2K6 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP20Q9Y2K6 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC18■□□□□ 0.47
USP20Q9Y2K6 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
USP20Q9Y2K6 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP20Q9Y2K6 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
USP20Q9Y2K6 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
USP20Q9Y2K6 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
USP20Q9Y2K6 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP20Q9Y2K6 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP20Q9Y2K6 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP20Q9Y2K6 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP20Q9Y2K6 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP20Q9Y2K6 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP20Q9Y2K6 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP20Q9Y2K6 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP20Q9Y2K6 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP20Q9Y2K6 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP20Q9Y2K6 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP20Q9Y2K6 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP20Q9Y2K6 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP20Q9Y2K6 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP20Q9Y2K6 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP20Q9Y2K6 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
USP20Q9Y2K6 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP20Q9Y2K6 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP20Q9Y2K6 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP20Q9Y2K6 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP20Q9Y2K6 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
USP20Q9Y2K6 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP20Q9Y2K6 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
USP20Q9Y2K6 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP20Q9Y2K6 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP20Q9Y2K6 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP20Q9Y2K6 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP20Q9Y2K6 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP20Q9Y2K6 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP20Q9Y2K6 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP20Q9Y2K6 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP20Q9Y2K6 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
USP20Q9Y2K6 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP20Q9Y2K6 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP20Q9Y2K6 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
USP20Q9Y2K6 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP20Q9Y2K6 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP20Q9Y2K6 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP20Q9Y2K6 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP20Q9Y2K6 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP20Q9Y2K6 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP20Q9Y2K6 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP20Q9Y2K6 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP20Q9Y2K6 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP20Q9Y2K6 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP20Q9Y2K6 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP20Q9Y2K6 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP20Q9Y2K6 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
USP20Q9Y2K6 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms