Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHF8Q9UPP1 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms