Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC12A4Q9UP95 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms