Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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COPS3Q9UNS2 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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