Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL63

MKLN1, Muskelin, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKLN1Q9UL63 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms