Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL01

DSE, Dermatan-sulfate epimerase, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSEQ9UL01 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSEQ9UL01 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSEQ9UL01 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSEQ9UL01 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSEQ9UL01 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSEQ9UL01 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSEQ9UL01 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSEQ9UL01 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
DSEQ9UL01 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
DSEQ9UL01 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSEQ9UL01 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSEQ9UL01 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSEQ9UL01 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
DSEQ9UL01 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSEQ9UL01 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSEQ9UL01 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSEQ9UL01 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
DSEQ9UL01 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSEQ9UL01 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
DSEQ9UL01 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSEQ9UL01 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSEQ9UL01 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSEQ9UL01 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSEQ9UL01 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSEQ9UL01 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSEQ9UL01 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSEQ9UL01 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DSEQ9UL01 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
DSEQ9UL01 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
DSEQ9UL01 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
DSEQ9UL01 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
DSEQ9UL01 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DSEQ9UL01 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms