Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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FOXD3Q9UJU5 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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FOXD3Q9UJU5 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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FOXD3Q9UJU5 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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FOXD3Q9UJU5 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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FOXD3Q9UJU5 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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FOXD3Q9UJU5 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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FOXD3Q9UJU5 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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FOXD3Q9UJU5 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
FOXD3Q9UJU5 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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