Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI40

SLC24A2, Sodium/potassium/calcium exchanger 2, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A2Q9UI40 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC24A2Q9UI40 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms