Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms