Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DKK3Q9UBP4 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms