Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms